14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0142 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  54.15 
 
 
659 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  56.25 
 
 
658 aa  746    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  52.73 
 
 
660 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  55.88 
 
 
681 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  100 
 
 
673 aa  1367    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  32.98 
 
 
691 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  32.98 
 
 
691 aa  348  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  33.97 
 
 
646 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  33.38 
 
 
650 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  34.15 
 
 
647 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  34.53 
 
 
689 aa  317  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  30.85 
 
 
830 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  33.06 
 
 
1204 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  35.02 
 
 
539 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>