111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3421 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3421  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
323 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3201  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  76.3 
 
 
310 aa  451  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2049  hypothetical protein  51.71 
 
 
275 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.451143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2694  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  51.21 
 
 
282 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0200  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.65 
 
 
298 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1729  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  51.4 
 
 
271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2048  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50.7 
 
 
271 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.161295  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4658  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  48.95 
 
 
275 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1085  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.65 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.196121  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2074  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  49.28 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.334644  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5280  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.54 
 
 
275 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.970105  normal  0.551146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4792  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  50 
 
 
275 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239471  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1288  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  45.83 
 
 
276 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2636  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  44.84 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2788  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  45.9 
 
 
273 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000742326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1809  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  40.42 
 
 
271 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.8 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.955887  hitchhiker  0.00580332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2968  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  38.71 
 
 
1139 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.33 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3104  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.3 
 
 
285 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0450134  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.21 
 
 
507 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.7 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  38.16 
 
 
280 aa  56.2  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.55 
 
 
450 aa  56.2  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.13 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.48 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.54 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  30.85 
 
 
499 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2134  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein-like  32.5 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  26.14 
 
 
294 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  46.25 
 
 
289 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  25 
 
 
282 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.16 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.33 
 
 
490 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.46 
 
 
286 aa  53.1  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.25 
 
 
288 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.64 
 
 
507 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.35 
 
 
507 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  30.13 
 
 
280 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  25.65 
 
 
496 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.56 
 
 
468 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2041  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.96 
 
 
292 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.84 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  28.96 
 
 
496 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.07 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1676  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.07 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.991973  normal  0.682256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0489  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  35.06 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0500  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  35.06 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.721934 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0478  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  35.06 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.81 
 
 
492 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  42.47 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  23.85 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.76 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0498  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.58 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.866988  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.1 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.33 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.47 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5357  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.94 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.68 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.17 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.84 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  40 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.13 
 
 
518 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  42.86 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10380  carbon monoxyde dehydrogenase medium subunit  33.77 
 
 
300 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121172  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.11 
 
 
496 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.42 
 
 
290 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203771  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.64 
 
 
480 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.7 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5284  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.66 
 
 
290 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1956  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.42 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30 
 
 
292 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.74 
 
 
289 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.83 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.87 
 
 
461 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  31.11 
 
 
480 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.58 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.48 
 
 
275 aa  45.8  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  27.03 
 
 
494 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.98 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.55 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.48 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3730  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  35.96 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.13 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.41 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.5 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.23 
 
 
484 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.9 
 
 
280 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0222  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.47 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.79 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  26.79 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  31.43 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.23 
 
 
512 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.97 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.48 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.19 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.14 
 
 
481 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0228  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.27 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0985193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  26.37 
 
 
488 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>