15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0852 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0852  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0138661  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3086  hypothetical protein  25.55 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1808  hypothetical protein  24.8 
 
 
322 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323133  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1987  hypothetical protein  27.73 
 
 
322 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2406  hypothetical protein  24.91 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3648  hypothetical protein  23.22 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00319764  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2248  hypothetical protein  24.72 
 
 
307 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.332155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22110  hypothetical protein  24.51 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000302084  unclonable  4.28855e-22 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1288  hypothetical protein  21.86 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0871  hypothetical protein  23.9 
 
 
308 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1020  hypothetical protein  21.07 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.673625  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1257  hypothetical protein  20.71 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1171  putative bacteriophage protein  21.8 
 
 
355 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3481  hypothetical protein  19.58 
 
 
314 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000172273  normal  0.0268237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2823  hypothetical protein  23.58 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>