13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0054 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00173253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00409561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00426558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.715121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0041  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0049  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0053  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>