8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_R0052 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00409561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0053  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0055  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0054  tRNA-Ala  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00173253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0018  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0290515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>