16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6882 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  100 
 
 		 219 aa  410  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  40.99 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  40.64 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  39.82 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  38.94 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  38.94 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  38.94 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  38.22 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  33.47 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  27.8 
 
 		 253 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  25.24 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  26.46 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  32.76 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  32.17 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4710  polysaccharide deacetylase  31.3 
 
 		 245 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.770793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  32.17 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>