33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6762 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  327  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  46.67 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  35.5 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  35.5 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  36.09 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  32.34 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  32.34 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  32.34 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  34.09 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  31.13 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  32.12 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  30 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  33.13 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  33.13 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  33.13 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  34.23 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  25.93 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  25.43 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  30.06 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  30.97 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  25 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  30.17 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  28.29 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  31.68 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1241  hypothetical protein  26.58 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  24.67 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  23.88 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  28.14 
 
 		 394 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  23.17 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>