25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6505 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6505  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain  100 
 
 		 621 aa  1170    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04950  hypothetical protein  41.18 
 
 		 402 aa  179  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1365  hypothetical protein  33.8 
 
 		 508 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.113149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4858  hypothetical protein  32.12 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.127586  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0609  hypothetical protein  30.82 
 
 		 787 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1873  hypothetical protein  30.66 
 
 		 478 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0211356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3306  hypothetical protein  30.31 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2575  hypothetical protein  31.3 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10973  integral membrane protein  30.09 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0198521  normal  0.799672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1245  hypothetical protein  30.98 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537761  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4218  hypothetical protein  33.51 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.341342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0656  hypothetical protein  30.08 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1162  hypothetical protein  34.19 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000484736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4200  hypothetical protein  31.78 
 
 		 422 aa  54.7  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0938646  hitchhiker  0.00891245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1269  hypothetical protein  39.81 
 
 		 486 aa  54.3  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0914584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4701  hypothetical protein  30.71 
 
 		 472 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0063  hypothetical protein  31.29 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586745 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  26.67 
 
 		 3268 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4407  hypothetical protein  30.71 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4321  hypothetical protein  30.71 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1086  hypothetical protein  26.94 
 
 		 438 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7983  hypothetical protein  35.37 
 
 		 530 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0382  hypothetical protein  38.89 
 
 		 410 aa  50.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0675  hypothetical protein  31.4 
 
 		 460 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.825925  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3810  hypothetical protein  28 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>