27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5875 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5875  Patatin  100 
 
 		 646 aa  1269    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.854691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2024  patatin  32.1 
 
 		 631 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0531  hypothetical protein  37.7 
 
 		 605 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0560  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  38.76 
 
 		 605 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0216  Patatin  30.87 
 
 		 624 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1993  putative suppressor  33.91 
 
 		 630 aa  137  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0563  thermosensitive mutation transmembrane protein, SuhR  37.26 
 
 		 605 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4103  patatin  27.41 
 
 		 685 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000427908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3069  hypothetical protein  33.07 
 
 		 782 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2994  Patatin  29.12 
 
 		 666 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1013  hypothetical protein  32.46 
 
 		 782 aa  122  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.757168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  34.85 
 
 		 343 aa  55.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  25.37 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1130  patatin  29.04 
 
 		 341 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1228  Patatin  41.38 
 
 		 332 aa  47.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  39.74 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  39.74 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12074  transmembrane protein  32.76 
 
 		 324 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  38.46 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  38.46 
 
 		 321 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  38.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  38.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  38.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  38.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  38.46 
 
 		 321 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1855  patatin  38.46 
 
 		 321 aa  44.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  27.92 
 
 		 293 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>