15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4118 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7000  hypothetical protein  72.96 
 
 		 328 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2698  hypothetical protein  67.99 
 
 		 328 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2178  hypothetical protein  69.61 
 
 		 320 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319459  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4111  hypothetical protein  56.48 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0556  hypothetical protein  57.93 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6359  hypothetical protein  54.84 
 
 		 339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400422  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0694  hypothetical protein  51.44 
 
 		 305 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0871  hypothetical protein  49.03 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0867  hypothetical protein  48.53 
 
 		 305 aa  255  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0597  hypothetical protein  48.9 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8248  hypothetical protein  39.87 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0300735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  29.62 
 
 		 951 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4058  hypothetical protein  30.59 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1982  hypothetical protein  28.93 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>