15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3220 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3116  hypothetical protein  61.66 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0221368  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3225  hypothetical protein  51.72 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1574  hypothetical protein  62.5 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.60477  hitchhiker  0.00480214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03040  hypothetical protein  55.49 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3208  hypothetical protein  52.71 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.642161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13040  hypothetical protein  47.37 
 
 		 255 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4794  hypothetical protein  42.33 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0851  hypothetical protein  49.44 
 
 		 201 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00740746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4901  hypothetical protein  48.86 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1331  hypothetical protein  43.72 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1905  hypothetical protein  42.39 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2550  hypothetical protein  29.38 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2817  hypothetical protein  25.29 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.508332  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1491  hypothetical protein  25.64 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00278344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>