9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3120 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3120    100 
 
 		 532 bp  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  88.19 
 
 		 885 bp  133  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37300    88.19 
 
 		 883 bp  133  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  96.55 
 
 		 567 bp  50.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3085    91.89 
 
 		 429 bp  50.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  96.43 
 
 		 489 bp  48.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4462  IS1647-like transposase  96.43 
 
 		 387 bp  48.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 207 bp  46.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.121828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3438  putative transposase  100 
 
 		 438 bp  46.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>