14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2470 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3561  hypothetical protein  40.25 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03420  hypothetical protein  40.79 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0809  hypothetical protein  40.32 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.612305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0503  hypothetical protein  34.62 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0626  putative secreted lipoprotein  33.33 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0753  putative secreted lipoprotein  38.1 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3513  hypothetical protein  45.92 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2998  hypothetical protein  39.55 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0713  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6255  hypothetical protein  35.96 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0739  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 590 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0724  hypothetical protein  39.5 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00634276  normal  0.0883262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>