27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1454 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  100 
 
 		 174 aa  337  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  42.11 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6038  hypothetical protein  38.86 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8261  hypothetical protein  38.33 
 
 		 200 aa  87.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0410012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  34.09 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  34.97 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  32.94 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  35 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14500  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  31.14 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.111122 
 
 
-
 
NC_003296  RS05465  hypothetical protein  29.95 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889335  normal  0.0895575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  32.97 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0066  hypothetical protein  34.71 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  31.52 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0998  hypothetical protein  30.14 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9282  hypothetical protein  30.89 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0870  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0926819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4308  hypothetical protein  28.77 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0177  hypothetical protein  28.04 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3746  protein of unknown function DUF1470  32.62 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4823  protein of unknown function DUF1470  32.62 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  28.02 
 
 		 198 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5828  hypothetical protein  27.49 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>