More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2842 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
309 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  98.38 
 
 
309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  74.84 
 
 
307 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  70.26 
 
 
308 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  75.58 
 
 
316 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  68.33 
 
 
301 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  64.69 
 
 
301 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  63.04 
 
 
301 aa  334  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  60.8 
 
 
304 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
329 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  47.13 
 
 
336 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  46.33 
 
 
309 aa  221  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  48.33 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  41.56 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  43.77 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 
339 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
302 aa  202  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  39.26 
 
 
320 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  39.46 
 
 
320 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  39.46 
 
 
320 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  39.46 
 
 
320 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 
320 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 
320 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 
320 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 
324 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
324 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 
319 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
320 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  38.49 
 
 
329 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 
324 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  39.46 
 
 
321 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
369 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
332 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
323 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
319 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
319 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
322 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
326 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
326 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
319 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
326 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
326 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
326 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
326 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
354 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
332 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 
324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 
324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
324 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 
322 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  37.92 
 
 
322 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 
354 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  32.48 
 
 
327 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  31.62 
 
 
327 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  29.75 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  32.9 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  28.42 
 
 
333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  29.54 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  31.2 
 
 
334 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  34.62 
 
 
332 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
346 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  29.91 
 
 
333 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  32.65 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  28.39 
 
 
317 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  30.99 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  30.99 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  27.97 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  27.8 
 
 
334 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  33.75 
 
 
351 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  28.23 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  27.23 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  27.43 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2660  hypothetical protein  29.13 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0870271  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3131  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  32.51 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  29.7 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15730  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.278533  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
392 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29911  hypothetical protein  27.8 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0158  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  0.0330567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>