26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1895 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1895    100 
 
 		 1291 bp  2559    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    100 
 
 		 3611 bp  2559    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1654  hypothetical protein  87.68 
 
 		 1023 bp  942    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.696062  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    83.51 
 
 		 1113 bp  615  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1165    82.75 
 
 		 905 bp  412  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1655  hypothetical protein  94.07 
 
 		 270 bp  408  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.549221  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1312    81.47 
 
 		 965 bp  163  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.293835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0547    84.57 
 
 		 420 bp  135  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  83.74 
 
 		 1233 bp  85.7  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    89.04 
 
 		 1271 bp  81.8  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0352    83 
 
 		 1213 bp  63.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3245    89.8 
 
 		 2780 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.884067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0899    89.8 
 
 		 2433 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.811127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  89.8 
 
 		 1197 bp  58  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1233 bp  58  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1233 bp  58  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  84.42 
 
 		 1233 bp  58  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  80.77 
 
 		 1200 bp  48.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  80.77 
 
 		 1200 bp  48.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>