33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1500 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  235  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0892806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  50.82 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  56.36 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  44.9 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  31.58 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23740  RNA-binding protein (KH domain)  56.86 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.860329  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  63.04 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  60.42 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  54.55 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  58.33 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  44.93 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0225  hypothetical protein  44.62 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  57.78 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  58.7 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  69.7 
 
 		 80 aa  42  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  36.76 
 
 		 77 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  54.9 
 
 		 79 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0647  RNA-binding protein  27.94 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.534792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  37.78 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0980  hypothetical protein  51.11 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.747535  normal  0.258716 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  33.33 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1942  hypothetical protein  48.33 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3135  KH domain-containing protein  57.14 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  64.1 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>