14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1207 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1207  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  762    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  26.8 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  28.64 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4840  hypothetical protein  25.63 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  26.06 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0752  hypothetical protein  33.19 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0930  hypothetical protein  28.45 
 
 		 390 aa  86.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0385  hypothetical protein  27.49 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01680  hypothetical protein  27.41 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.607562  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  26.9 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  26.15 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.23 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  27.23 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5741  hypothetical protein  33.7 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>