18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2403 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2403  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  889    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1555  hypothetical protein  95.33 
 
 
428 aa  862    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1460  hypothetical protein  95.09 
 
 
428 aa  859    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0243  hypothetical protein  80.1 
 
 
409 aa  675    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2122  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
312 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.959895  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2850  cytochrome c class I  31.79 
 
 
312 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  24.33 
 
 
743 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0208  hypothetical protein  39.56 
 
 
179 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  40.54 
 
 
117 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4624  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.97 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250925  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1619  FixOc  32.26 
 
 
199 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6267  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 
243 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5934  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 
243 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632943  normal  0.24446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  35.14 
 
 
117 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0731  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  27.62 
 
 
244 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0943795  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0019  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
244 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0016  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 
244 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4126  cytochrome C oxidase, mono-heme subunit/FixO  25.42 
 
 
200 aa  43.1  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>