40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4623 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
82 aa  164  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.48 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  43.59 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.59 
 
 
80 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.59 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.46 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.89 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  47.37 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  38.46 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.37 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2066  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.33 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  36.25 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.9 
 
 
79 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0428  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.65 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0073  ChpR family protein  37.5 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.261005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3308  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.62 
 
 
80 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.18 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  39.29 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.22 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.76 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.4 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.84 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.84 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.8 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.31 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1936  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.23 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60.71 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.71 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  42.55 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3899  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.11 
 
 
87 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.957207  normal  0.173268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>