19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1803 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  274  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  58.95 
 
 
109 aa  126  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  39.29 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  27.72 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  27.42 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  35.16 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  35.48 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  40.74 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  32.76 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4223  hypothetical protein  28.81 
 
 
123 aa  40.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279869  hitchhiker  0.00388236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  30.09 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3613  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>