260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0220 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  100 
 
 		 51 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  72.73 
 
 		 47 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  67.39 
 
 		 52 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  72.09 
 
 		 44 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 45 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 52 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 47 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  72.09 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4513  ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 45 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 45 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 48 aa  60.5  0.000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  64.44 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5096  ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 45 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  72.09 
 
 		 44 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  60.87 
 
 		 47 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4548  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0003403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9389  50S ribosomal protein L34P  64.44 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0319883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4700  50S ribosomal protein L34P  64.44 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271583  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 45 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3379  ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 45 aa  58.9  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  69.77 
 
 		 44 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4172  50S ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 45 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000696082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  62.22 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  69.05 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  67.44 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  58.7 
 
 		 47 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  59.18 
 
 		 52 aa  57  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4618  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 46 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 		 45 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  65.91 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  69.05 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3034  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0001  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.549372  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2827  50S ribosomal protein L34P  65.12 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0828  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3545  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3760  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4245  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000109099  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 46 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3461  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6487  50S ribosomal protein L34  57.78 
 
 		 45 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00156279  normal  0.0851435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23480  LSU ribosomal protein L34P  60 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6078  50S ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 47 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0153372  normal  0.186265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4796  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4143  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5015  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27040  LSU ribosomal protein L34P  57.78 
 
 		 45 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  66.67 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3463  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00766604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2199  ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000155667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2033  50S ribosomal protein L34  64.44 
 
 		 51 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.778923  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4243  ribosomal protein L34  58.14 
 
 		 47 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0239803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1194  ribosomal protein L34  60.87 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000642694  decreased coverage  0.000208827 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0926  50S ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 46 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320545  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2132  50S ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 53 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189497  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2779  ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0322855  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2524  ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 53 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.480913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2147  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  2.00251e-17  unclonable  0.00000111229 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0001  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283755  hitchhiker  0.00000000552795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0002  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000727123  unclonable  0.0000468434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  62.22 
 
 		 52 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0446  50S ribosomal protein L34  61.36 
 
 		 51 aa  53.9  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1043  50S ribosomal protein L34  60 
 
 		 46 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000531959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_914  ribosomal protein L34  60 
 
 		 46 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000254245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2512  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 45 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2884  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 		 44 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715219  normal  0.406653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  62.79 
 
 		 46 aa  52.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  64.29 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4017  50S ribosomal protein L34  65.12 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00224916  normal  0.155192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4864  ribosomal protein L34  55.81 
 
 		 47 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2414  ribosomal protein L34  60.47 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00945499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>