14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1056 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 270 aa  519  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1430  hypothetical protein  49.79 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.0390822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5082  ABC-2 type transporter  51.39 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 367 aa  48.9  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0478  ABC-2 type transporter  23.23 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  24.68 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.88 
 
 		 254 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.58 
 
 		 339 aa  42  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>