13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0023 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_R0048  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.818398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0023  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0043  tRNA-Lys  97.22 
 
 
72 bp  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00459429  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0049  tRNA-Lys  90.28 
 
 
72 bp  87.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.319616  normal  0.525393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0046  tRNA-Lys  88.89 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0005  tRNA-Lys  88.89 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0047  tRNA-Lys  88.89 
 
 
72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0672814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0030  tRNA-Lys  86.11 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.49638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALysVIMSS1309293  tRNA-Lys  84.72 
 
 
72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.180997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0030  tRNA-Lys  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186528  normal  0.069463 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  83.87 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  83.87 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0763324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>