13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4587 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0109  hypothetical protein  38.1 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2848  hypothetical protein  48.68 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  0.122142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0835  hypothetical protein  40.45 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0666  hypothetical protein  33.9 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131147  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0152  hypothetical protein  38.89 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5682  hypothetical protein  38.26 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0667  hypothetical protein  37.93 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297183  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  34.26 
 
 
110 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  34.23 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  37.97 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  33.73 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  38.46 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>