14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4334 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  407  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  53.67 
 
 
318 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  59.01 
 
 
289 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  55.88 
 
 
302 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  58.45 
 
 
161 aa  160  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  49.13 
 
 
293 aa  158  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  35.66 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  30.32 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  29.27 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  32.05 
 
 
427 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  31.31 
 
 
262 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1775  hypothetical protein  29.29 
 
 
396 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.062181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1102  hypothetical protein  56.41 
 
 
92 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  30.77 
 
 
436 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>