14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3187 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3187  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  328  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0990  hypothetical protein  67.48 
 
 
293 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4707  hypothetical protein  71.52 
 
 
289 aa  207  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1107  hypothetical protein  59.04 
 
 
318 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0283208  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4334  hypothetical protein  58.45 
 
 
194 aa  160  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.468137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3853  hypothetical protein  50.88 
 
 
302 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0478  hypothetical protein  34.93 
 
 
308 aa  84  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00102471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2561  hypothetical protein  30.5 
 
 
296 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5645  hypothetical protein  30.28 
 
 
312 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1603  hypothetical protein  33.64 
 
 
262 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0166  hypothetical protein  30.43 
 
 
436 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1102  hypothetical protein  79.31 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6097  hypothetical protein  37.14 
 
 
427 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3775  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>