20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2172 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2172  acyltransferase 3  100 
 
 
393 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219219  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2295  acyltransferase 3  55.73 
 
 
387 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.976705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2806  acyltransferase 3  55.73 
 
 
387 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.475519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2401  acyltransferase 3  54.99 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.56847  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  44.5 
 
 
366 aa  266  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3370  acyltransferase 3  47.11 
 
 
370 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.365028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3139  acyltransferase 3  50.94 
 
 
361 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.586381  normal  0.0112196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3984  acyltransferase 3  43.92 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487902  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2122  acyltransferase 3  46.74 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0178  acyltransferase 3  39.3 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0351  acyltransferase 3  35.63 
 
 
362 aa  173  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0589  acyltransferase 3  43.65 
 
 
363 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  26.62 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  25.13 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  25.13 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  25.99 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  24.24 
 
 
344 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  24.88 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  20.63 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  20.63 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>