13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1939 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 132 aa  254  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.48 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.765233  hitchhiker  0.000000449148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1480  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.89 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.934887  normal  0.224655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.52 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.52 
 
 		 439 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 435 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 450 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 		 430 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>