32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1839 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1839  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
265 aa  511  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1729  cytochrome c assembly protein  24.24 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.622186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1763  cytochrome c assembly protein  24.24 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1235  hemX protein  27.81 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.299546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  31.55 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.42 
 
 
271 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.41 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3181  cytochrome c assembly protein  21.26 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  27 
 
 
276 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4583  hemX protein  20.47 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2581  cytochrome c assembly protein  23.31 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4310  cytochrome c assembly protein  21.21 
 
 
277 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4556  hemX protein  22.75 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0651  hemX protein  20.87 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.32 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  28.49 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  27.57 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  29.11 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4362  hemX protein  22.75 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4198  hemX protein  22.75 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4209  hemX protein  22.75 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4552  hemX protein  22.75 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4601  hemX protein  24.81 
 
 
277 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4697  hemX protein  22.75 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  25.96 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0871  cytochrome c assembly protein  22.93 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.74 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1517  HemX protein, putative  24.21 
 
 
277 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.66 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1122  cytochrome c assembly protein  24.44 
 
 
277 aa  42  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.719311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1149  cytochrome c assembly protein  34.19 
 
 
264 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>