11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10258 on replicon BN001307
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_10258  anaphase-promoting complex subunit ApcB, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05210)  100 
 
 
918 aa  1889    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87387  predicted protein  30.58 
 
 
830 aa  251  4e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.929125 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44236  predicted protein  32.27 
 
 
866 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963613  normal  0.0380429 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02340  ubiquitin-protein ligase, putative  35.16 
 
 
656 aa  227  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664137  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47273  predicted protein  27.94 
 
 
767 aa  212  3e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662856  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29317  CULlin protein 1  26.11 
 
 
741 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291642  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10008  ubiquitin ligase subunit CulD, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12680)  26.2 
 
 
880 aa  56.2  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.122406  normal  0.163465 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45419  predicted protein  26.05 
 
 
702 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50090  predicted protein  25 
 
 
745 aa  55.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33783  predicted protein  24.66 
 
 
786 aa  51.2  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.365007 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44571  CULlin protein 4  25.7 
 
 
821 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.457132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>