23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_08704 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_08704  60S ribosomal protein L24a (AFU_orthologue; AFUA_6G02440)  100 
 
 
160 aa  311  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88185  predicted protein  61.88 
 
 
155 aa  164  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0390204  normal  0.523172 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02920  60S ribosomal protein L24 (L30), putative  61.07 
 
 
150 aa  155  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19152  predicted protein  42 
 
 
157 aa  107  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43138  Ribosomal protein L24, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.14 
 
 
127 aa  88.6  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119514  ribosome biogenesis protein RLP24, probable  30.34 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.42721  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7346  predicted protein  32.81 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03010  ribosomal large subunit biogenesis-related protein, putative  33.33 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59191  predicted protein  32.31 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.32572  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1499  50S ribosomal protein L24E  44 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.172972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0525  Ribosomal protein L24E  38.78 
 
 
63 aa  47.8  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0453  Ribosomal protein L24E  37.25 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.541731  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04560  60S ribosomal protein L24b (AFU_orthologue; AFUA_2G02710)  38.46 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2525  Ribosomal protein L24E  35.71 
 
 
121 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0311  ribosomal protein L24E  39.62 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0688  ribosomal protein L24E  38.3 
 
 
63 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0719  ribosomal protein L24E  34.69 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0204081  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1603  ribosomal protein L24E  38 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.734054 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1208  Ribosomal protein L24E  38 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.568383  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0588  50S ribosomal protein L24e  37.74 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.963805  hitchhiker  0.000164572 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1238  Ribosomal protein L24E  32.08 
 
 
81 aa  41.2  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1758  50S ribosomal protein L24e  32.35 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0237354  hitchhiker  0.00246446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0442  50S ribosomal protein L24e  39.62 
 
 
62 aa  41.2  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>