21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2415 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.612018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2046  CopG domain protein DNA-binding domain protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.30352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1314  CopG domain protein DNA-binding domain protein  97.47 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0787  CopG/DNA-binding domain-containing protein  56.41 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1008  hypothetical protein  56.25 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0154  hypothetical protein  50.63 
 
 		 81 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0264  hypothetical protein  46.25 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1870  hypothetical protein  47.69 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.530557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1617  hypothetical protein  41.67 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.11384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2757  hypothetical protein  49.09 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2196  hypothetical protein  43.1 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0130  hypothetical protein  43.1 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2271  hypothetical protein  41.38 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.941598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0659  hypothetical protein  39.66 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4529  hypothetical protein  53.49 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1381  hypothetical protein  53.49 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164857  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3822  hypothetical protein  53.49 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00659964  normal  0.293452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4094  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.987137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3747  hypothetical protein  45.61 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0692  hypothetical protein  47.62 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>