25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1122 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1122  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0215  hypothetical protein  55.95 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1942  hypothetical protein  48.81 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0436  hypothetical protein  48.48 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.889027  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4277  hypothetical protein  48.65 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03065  hypothetical protein  41.98 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2656  hypothetical protein  44.12 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.482309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6828  hypothetical protein  43.84 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0155  hypothetical protein  44.93 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123262  hitchhiker  0.0000255316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2354  hypothetical protein  43.06 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.907944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1722  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2328  hypothetical protein  37.04 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00898416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3623  hypothetical protein  38.16 
 
 		 183 aa  52.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26500  hypothetical protein  38.16 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.407608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0713  hypothetical protein  40.79 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145016  hitchhiker  0.00000285629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8119  hypothetical protein  33.78 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0919  hypothetical protein  37.97 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0454147  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04100  hypothetical protein  36.84 
 
 		 310 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0790  hypothetical protein  35.9 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3746  hypothetical protein  35.82 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0277012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1249  hypothetical protein  35.53 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00737651  normal  0.251434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3956  hypothetical protein  32.43 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1381  hypothetical protein  36.71 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.122894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3751  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1030  hypothetical protein  38.1 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0212795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>