26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_14951 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  96.41 
 
 
223 aa  417  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  93.27 
 
 
223 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  74.44 
 
 
222 aa  296  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  52.8 
 
 
222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  51.4 
 
 
222 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  44.59 
 
 
278 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  48.62 
 
 
221 aa  204  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0871  hypothetical protein  46.08 
 
 
222 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390024  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1528  hypothetical protein  48.15 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.862342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  30.13 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  25.11 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  25.45 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  32.09 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  27.01 
 
 
239 aa  62.4  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  28.44 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  26.48 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  25.12 
 
 
997 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  30.23 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  28.81 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  25.25 
 
 
309 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  29.29 
 
 
208 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0225  transport-associated protein  26.94 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0462  hypothetical protein  27.15 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0489  hypothetical protein  32.14 
 
 
199 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  23.78 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>