19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3952 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  93.88 
 
 
245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  84.56 
 
 
259 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  40.3 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  31.68 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  25.69 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  31.86 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  31.82 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  24.22 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  28.18 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  32.61 
 
 
281 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  27.07 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  32.41 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  35.45 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4425  putative cytoplasmic protein  32.88 
 
 
208 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7283  hypothetical protein  26.17 
 
 
222 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.316954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  32.53 
 
 
282 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1641  hypothetical protein  28.41 
 
 
188 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>