22 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Caul_0398  CDS  NC_010338  437644  438492  849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001682033  unclonable  9.26955e-14  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_0602  CDS  NC_010338  664446  665294  849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001682233  unclonable  3.51329e-14  normal  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1152  CDS  NC_010338  1217970  1220828  2859  conjugal transfer relaxase TraA  YP_001682780  hitchhiker  0.00271398  unclonable  4.34964e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1153  CDS  NC_010338  1220838  1221539  702  hypothetical protein  YP_001682781  hitchhiker  6.89091e-09  unclonable  1.66393e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1154  CDS  NC_010338  1221685  1222278  594  hypothetical protein  YP_001682782  unclonable  1.30498e-14  unclonable  1.51962e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1155  CDS  NC_010338  1222275  1223102  828  putative transcriptional regulator  YP_001682783  hitchhiker  1.63993e-09  unclonable  1.64707e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_1843  CDS  NC_010338  1960245  1963496  3252  TonB-dependent receptor  YP_001683470  unclonable  1.98025e-08  decreased coverage  0.000327731  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_2773  CDS  NC_010338  3012434  3012874  441  hypothetical protein  YP_001684398  hitchhiker  9.9126e-09  unclonable  1.40227e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_2774  CDS  NC_010338  3012871  3013500  630  hypothetical protein  YP_001684399  hitchhiker  6.70042e-10  unclonable  1.53517e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_2775  CDS  NC_010338  3013481  3014149  669  hypothetical protein  YP_001684400  unclonable  1.96673e-14  unclonable  1.69816e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3792  CDS  NC_010338  4109096  4109809  714  sugar fermentation stimulation protein A  YP_001685416  normal  0.144138  unclonable  1.69816e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3793  CDS  NC_010338  4109820  4110650  831  methionine aminopeptidase, type I  YP_001685417  normal  0.0861362  unclonable  1.66393e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3794  CDS  NC_010338  4110754  4111344  591  DNA repair protein RadC  YP_001685418  normal  0.0842954  unclonable  1.53517e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3795  CDS  NC_010338  4111503  4112744  1242  integrase family protein  YP_001685419  hitchhiker  0.000111159  unclonable  2.15958e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_3796  CDS  NC_010338  4112741  4113160  420  hypothetical protein  YP_001685420  hitchhiker  0.000706753  unclonable  1.50422e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5080  CDS  NC_010335  184  1437  1254  peptidase S10 serine carboxypeptidase  YP_001676514  unclonable  1.12364e-10  normal  0.0461552  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5264  CDS  NC_010335  200164  200772  609  hypothetical protein  YP_001676698  hitchhiker  0.00238  unclonable  1.82216e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5265  CDS  NC_010335  200772  201818  1047  hypothetical protein  YP_001676699  hitchhiker  0.00288645  unclonable  2.0149e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5266  CDS  NC_010335  202050  202319  270  hypothetical protein  YP_001676700  hitchhiker  5.81298e-05  unclonable  1.63116e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5267  CDS  NC_010335  202307  203341  1035  hypothetical protein  YP_001676701  hitchhiker  5.17296e-06  unclonable  2.25166e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5268  CDS  NC_010335  203344  203949  606  hypothetical protein  YP_001676702  hitchhiker  6.6667e-10  unclonable  1.99449e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5269  CDS  NC_010335  204546  209936  5391  hypothetical protein  YP_001676703  hitchhiker  0.00229781  unclonable  7.48398e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>