More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lplt41 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0066  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0931764  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  97.3 
 
 		 77 bp  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00051  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3136  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.364243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0063  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141165  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3153  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.311913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4080  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3215  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4492  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0467546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0011  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3316  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.863126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3216  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3584  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3646  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4079  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.043282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4081  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0905537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.628409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0062  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0029  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0027  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.992262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0763001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0792206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3201  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.145985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3547  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.226089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3479  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.344656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3478  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3135  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.369915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3315  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0008  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100905  hitchhiker  0.00491713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0383  tRNA-Met  96.05 
 
 		 79 bp  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>