16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_0066 on replicon NC_010158
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010158  YpAngola_0066  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  287  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00199934  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2991  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1137  hypothetical protein  32.65 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1846  hypothetical protein  33.81 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.599584  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1534  hypothetical protein  34.68 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.755909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2623  hypothetical protein  29.01 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21510  hypothetical protein  29.1 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0404616  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2481  hypothetical protein  28.68 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28440  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000616555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1830  hypothetical protein  27.61 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0027  hypothetical protein  30.56 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.427776  hitchhiker  0.00681034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0822  hypothetical protein  25.62 
 
 
129 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0451  hypothetical protein  28.26 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000603565  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1995  hypothetical protein  28.04 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.235455  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2265  hypothetical protein  30.34 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2728  hypothetical protein  26.25 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392441  normal  0.179317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>