17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0822 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0822  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  256  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0751  hypothetical protein  48.21 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0662  hypothetical protein  47.17 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0655  hypothetical protein  44.64 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0632  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0626  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00611576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4577  hypothetical protein  46.96 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0408581  hitchhiker  0.00580062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0587  hypothetical protein  47.62 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1566  hypothetical protein  48.39 
 
 		 137 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18050  hypothetical protein  47.31 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.920575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28440  hypothetical protein  33.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2481  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0066  hypothetical protein  25.62 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2728  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392441  normal  0.179317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1137  hypothetical protein  29.55 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2623  hypothetical protein  24.55 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133706 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0451  hypothetical protein  28.41 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000603565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>