15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0451 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  183  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000603565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2991  hypothetical protein  32.95 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1137  hypothetical protein  33.68 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0655  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28440  hypothetical protein  29.55 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616555 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2623  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1581  hypothetical protein  31.4 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2481  hypothetical protein  29.55 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0751  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1316  hypothetical protein  29.87 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00633996  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0066  hypothetical protein  28.26 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1534  hypothetical protein  25.81 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.755909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21510  hypothetical protein  29.21 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0404616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0822  hypothetical protein  28.41 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1846  hypothetical protein  26.67 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.599584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>