13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2991 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2623  hypothetical protein  41.84 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133706 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0066  hypothetical protein  35.82 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1137  hypothetical protein  33.81 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1846  hypothetical protein  33.07 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.599584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1534  hypothetical protein  30.95 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.755909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21510  hypothetical protein  31.01 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0404616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1830  hypothetical protein  32.61 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28440  hypothetical protein  27.21 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2481  hypothetical protein  29.77 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0451  hypothetical protein  32.95 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000603565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1581  hypothetical protein  31.15 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0027  hypothetical protein  28.46 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.427776  hitchhiker  0.00681034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>