30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0587 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0587  hypothetical protein  100 
 
 		 1117 aa  2323    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.720861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1070  hypothetical protein  99.73 
 
 		 1095 aa  2269    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.243584 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  38.37 
 
 		 1113 aa  699    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0526  hypothetical protein  99.46 
 
 		 1117 aa  2309    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1169 aa  625  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1076 aa  594  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1136 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1094 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  32.84 
 
 		 1145 aa  558  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1100 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3576  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1195 aa  327  8.000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.61557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  23.65 
 
 		 2870 aa  69.3  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  22.15 
 
 		 2716 aa  68.9  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  21.41 
 
 		 2823 aa  65.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  22.44 
 
 		 2747 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  22.57 
 
 		 2880 aa  62.4  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  24.63 
 
 		 849 aa  61.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  22.04 
 
 		 2922 aa  58.9  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  22.7 
 
 		 2758 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  22.49 
 
 		 2748 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  21.9 
 
 		 2786 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  21.66 
 
 		 2748 aa  52  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  24.39 
 
 		 1303 aa  52  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  22.51 
 
 		 2779 aa  50.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  20.75 
 
 		 624 aa  49.3  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  22.76 
 
 		 2833 aa  48.9  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  21.68 
 
 		 2929 aa  47.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  18.49 
 
 		 2887 aa  47  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  20.67 
 
 		 2884 aa  46.2  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  21.7 
 
 		 2842 aa  45.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>