25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0286 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0286  rubrerythrin  100 
 
 
174 aa  354  3e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3779  rubrerythrin  70.39 
 
 
163 aa  230  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1839  hypothetical protein  62.5 
 
 
162 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  60.78 
 
 
162 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2337  hypothetical protein  60.13 
 
 
159 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2009  hypothetical protein  58.17 
 
 
162 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3445  hypothetical protein  59.48 
 
 
162 aa  199  2e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35818  normal  0.0368438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3444  ferredoxin  42.11 
 
 
301 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.442671  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1840  ferredoxin  37.58 
 
 
302 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10400  hypothetical protein  41.78 
 
 
155 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2139  ferredoxin  39.6 
 
 
302 aa  119  2e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2010  ferredoxin  41.83 
 
 
301 aa  118  5e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  40.27 
 
 
167 aa  113  1e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10560  ferritin-like protein  43.45 
 
 
152 aa  109  2e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.639396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  42.36 
 
 
151 aa  104  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0695  rubrerythrin  39.37 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289242  normal  0.0810169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1530  rubrerythrin  34.01 
 
 
178 aa  82.8  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2957  Rubrerythrin  32.24 
 
 
179 aa  82.4  3e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6006  hypothetical protein  29.73 
 
 
286 aa  52.8  2e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00787853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  26.32 
 
 
175 aa  50.4  1e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2379  rubrerythrin  31.45 
 
 
337 aa  50.4  1e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  25.97 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  25.97 
 
 
174 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2863  rubrerythrin  27.63 
 
 
272 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  24.18 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>