23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0029 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  41.88 
 
 
174 aa  110  1e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  38.18 
 
 
175 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  41.67 
 
 
170 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  40.91 
 
 
161 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  39.44 
 
 
177 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  39.44 
 
 
177 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  40.14 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  38.73 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  40.13 
 
 
163 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  38.15 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  40.13 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  40.41 
 
 
169 aa  88.2  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  40.88 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  36.25 
 
 
166 aa  83.2  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  32.35 
 
 
171 aa  81.6  6e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  32.74 
 
 
176 aa  75.9  3e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  34.69 
 
 
161 aa  74.7  8e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  36.23 
 
 
185 aa  69.3  3e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  32.05 
 
 
170 aa  66.6  2e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  31.21 
 
 
170 aa  65.9  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  34.93 
 
 
198 aa  57.8  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  32.89 
 
 
314 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>