52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0422 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0422  membrane protein  100 
 
 
337 aa  681    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00291  hypothetical protein  63.88 
 
 
337 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002129  hypothetical protein  63.88 
 
 
337 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5136  hypothetical protein  29.9 
 
 
343 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5308  hypothetical protein  30.24 
 
 
343 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5549  hypothetical protein  30.24 
 
 
343 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5704  hypothetical protein  30.24 
 
 
343 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5150  hypothetical protein  29.9 
 
 
343 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2117  acyltransferase 3  27.68 
 
 
334 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00661626  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  24.7 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0817  acyltransferase 3  30.43 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923925  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1368  acyltransferase 3  23.86 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.79899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1412  polysaccharide biosynthesis protein (putative)  24.92 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.536858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1382  hypothetical protein  25.89 
 
 
375 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2581  acyltransferase 3  25.67 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4191  hypothetical protein  30.92 
 
 
370 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3111  acyltransferase 3  24.84 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0360298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1879  hypothetical protein  28.07 
 
 
373 aa  59.3  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3853  acyltransferase 3  26.7 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3981  acyltransferase 3  27.43 
 
 
331 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06310  hypothetical protein  24.23 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4108  putative acyltransferase  31.94 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4169  hypothetical protein  31.94 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273033 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0050  acyltransferase 3  31.94 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2065  acyltransferase 3  25 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.393482  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3872  acyltransferase 3  27.14 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3935  acyltransferase 3  27.14 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.876763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4040  acyltransferase 3  27.14 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.058021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0160  acyltransferase 3  26.23 
 
 
331 aa  53.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20920  hypothetical protein  27.81 
 
 
357 aa  53.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0873  acyltransferase 3  25.54 
 
 
376 aa  52.8  0.000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.128696 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0149  acyltransferase 3  26.71 
 
 
331 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4439  acyltransferase 3  23.03 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3884  acyltransferase family protein  25.73 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0093  hypothetical protein  29.17 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4937  acyltransferase family protein  25.81 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4157  acyltransferase 3  23.03 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4057  acyltransferase family protein  26.71 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1429  hypothetical protein  25.15 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.715682  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2465  acyltransferase 3  24.58 
 
 
362 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0144  hypothetical protein  25.55 
 
 
359 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0153  acyltransferase 3  28.67 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03413  conserved inner membrane protein  28.67 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3645  hypothetical protein  32.59 
 
 
387 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110018  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03364  hypothetical protein  28.67 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3764  acyltransferase family protein  28.67 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.748321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1856  acyltransferase 3  26.53 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0003  hypothetical protein  26.79 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2246  hypothetical protein  25.5 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.815625  normal  0.322709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  23.66 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3041  hypothetical protein  23.71 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1010  acyltransferase 3  29.79 
 
 
401 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.114811  hitchhiker  0.00000776761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>