136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02931 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  79.78 
 
 		 178 aa  288  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  70.52 
 
 		 173 aa  266  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  73.81 
 
 		 171 aa  243  8e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  53.85 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  53.85 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  53.85 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  52.98 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  183  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  50.3 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 178 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  50.3 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  49.7 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  49.7 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  54.86 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  50.89 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  50.3 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  46.24 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  49.11 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  51.48 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  46.39 
 
 		 169 aa  158  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  47.02 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  44.71 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  44.71 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  45.56 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  48.75 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  42.35 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  43.53 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  47.17 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  46.54 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  41.28 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  45.91 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  45.91 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  45.73 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  44.64 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  49.33 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  41.67 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  36.9 
 
 		 175 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  31.48 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  31.91 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  29.51 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  28.27 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  33.75 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1246  disulfide bond formation protein B  32.48 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.66054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  31.1 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3300  Disulphide bond formation protein DsbB  34.69 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  31.03 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4586  disulphide bond formation protein DsbB  31.25 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.62 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  27.46 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  31.11 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3585  disulfide bond formation protein B  32.39 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.711953  normal  0.299598 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  26.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  25.81 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1033  disulphide bond formation protein DsbB  29.25 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.194192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1312  disulfide bond formation protein B  34.11 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3145  disulphide bond formation protein DsbB  32.91 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  32 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2957  Disulphide bond formation protein DsbB  29.25 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  31.1 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1373  disulfide bond formation protein B  29.3 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.299022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  31.51 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0951  disulfide bond formation protein B  31.03 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  27.86 
 
 		 264 aa  57.8  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0034  disulfide bond formation protein  32.82 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0042  disulphide bond formation protein DsbB  32.82 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  27.86 
 
 		 261 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  28.17 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  28.66 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  28.66 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  32.45 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  28.66 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2549  disulphide bond formation protein DsbB  32.61 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2334  disulphide bond formation protein DsbB  30.88 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  28.66 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  28.66 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0761  disulphide bond formation protein DsbB  26.49 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  27.86 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2599  disulphide bond formation protein DsbB  30.88 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000270754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1862  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  31.08 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  25 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1403  disulfide bond formation protein B  30.53 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0530499  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0483  Disulphide bond formation protein DsbB  30.15 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.351521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3059  disulfide bond formation protein B  31.54 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  30 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>