28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0692 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  100 
 
 
276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  83.65 
 
 
271 aa  477  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  79.63 
 
 
216 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  49.04 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  49.04 
 
 
261 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  35.59 
 
 
234 aa  59.7  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  27.91 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  23.44 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  23.44 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  23.44 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  23.44 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  23.44 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  23.04 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  23.44 
 
 
240 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  23.44 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  23.44 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  24.47 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  22.49 
 
 
240 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  27.31 
 
 
448 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  22.01 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  21.11 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  28.05 
 
 
276 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  24.38 
 
 
383 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  29.21 
 
 
539 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  23.32 
 
 
387 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  23.32 
 
 
387 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  25.86 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  30.93 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>