10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0114 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1743  hypothetical protein  40.35 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69540  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149099  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0042  hypothetical protein  31.95 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3850  hypothetical protein  25.7 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1213  hypothetical protein  24.69 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2043  hypothetical protein  27.35 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5437  hypothetical protein  26.55 
 
 		 227 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2537  hypothetical protein  25.71 
 
 		 155 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43090  hypothetical protein  26.32 
 
 		 246 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.20878e-16  normal  0.206346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>