22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0195 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  100 
 
 
421 aa  834    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  35.33 
 
 
371 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  27.88 
 
 
439 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  26.65 
 
 
431 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  26.17 
 
 
428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  27.06 
 
 
429 aa  117  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  27.76 
 
 
425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  28.16 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  30.51 
 
 
353 aa  113  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  32.6 
 
 
287 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  30.22 
 
 
355 aa  100  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  27.99 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.48 
 
 
276 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  32.86 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  32.29 
 
 
295 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2475  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.12 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0801  GTPase or GTP-binding protein-like protein  32.74 
 
 
288 aa  76.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  28.16 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  26.76 
 
 
429 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48855  predicted protein  21.32 
 
 
903 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33311  predicted protein  20.5 
 
 
663 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.567773  normal  0.0126253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>